Небайдужі харків’яни, волонтери та фахівці звільняють з пасток, підбирають поранених, ослаблених і замерзлих тварин, всі види яких, що мешкають в Харківській області, занесені до Червоної книги, і доставляють їх у Центр. Там фахівці оглядають врятованих тварин, при необхідності лікують і годують їх, і влаштовують на зимівлю в комфортних для кажанів умовах

За зимовий сезон Центр рятує від декількох сотень до декількох тисяч кажанів. Навесні їх випускають назад у дику природу.

Співробітники Центру активно займаються науковими дослідженнями: вивчають ареал поширення, шляхи міграції та кількість рукокрилих і регулярно представляють їх результати на всеукраїнських та міжнародних конференціях. Центр співпрацює з міжнародною організацією EUROBATS, з представниками якої його фахівці проводять спільні дослідження на території України, Польщі, Угорщини, Румунії, Німеччини та інших країн.